Prof.Dr. Muzaffer Değertekin, tıp eğitimine 1990 yılında Hacettepe Üniversitesi Tıp Fakültesinde başladı. 1994 yılında Koşuyolu Kalp Eğitim ve Araştırma Hastanesi'nde uzmanlık eğitimini tamamladı.